Version 2.0
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DataBase of Tunicate Gene Regulation
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About DBTGR

Ci-collagen-alpha-1-XVIII

Organism: C. intestinalis
Dataset: JGI 1
Description: -3000:+200 region of ci0100148862
Promoter location: scaffold_244:43355-46554:+
Gene alias: ci0100148862

Sequence
ATAACCATAG CCCTACGACT CTAAGAGTGT ATTTAATTGT TCAAACCATG ATCAGGAAAT ATGGGATCTA GGTGCTAACG GTATCCAATC TTACCCCACA GTATACTATA CAAGAAACAG TGAATATAAA ATTTTAACAA ACAGATAAAT AAGTGTTTGA AATATTATAC CTGTACCTTC GTCCTGGTGT TAATTCGGTT CTTCTGTATC TAAAACCTCT ACTGCCAACC GCGAGGCATA GTAATACCAT TGCGAATAAT ACTAAGTGGA AACGAATCAT GCTGCCTTGC TGCTTATTAG TATTGACTGT TACCTGTTAG TAACAACACT TGCTTAAATA TTTGGTTCAA TTAGGATGTA TTTTCATAAA GTTGTGACCA GAAATGAAGC AAAACTTGTA CTGCGAAACG TTTAAAGTTT CGTTTTTTTC TGGTCGTGAC ACGATGTCAC ATGCAACGCT TGGCAAACGT GAATGGAATA GTACTGCAAA CTTTTATAAA GAATTACCAT TCGGTAACGT CGCATTGACA CACTGTCTCA CGTAATAAGA GAACAGAACT CTAATGACTG GGAAATATCG TTATAAAAAA TCTAAATATG CTTCTAAACG GACATAAATA GGTAACGGAC AAAAAATATA TAGGAGGGTG GGGGAATATG GGACTCCTTT TCATCCTATT TTCTTGTCCC ATTTGGTAGT AAACAAAGAA CATTCAAAGA ATTATAAAAC CATATCCGCA CAACTCCCAT AGACCGCTGT TAGTTGTTTA AAACACAATC AGGATATTTA GATATTATGT GCTAAAGGTG TCCCGTCTTC CCCCACTATA CTGTATTAAA CTAACAGATA AACATGAACA AAACATGGCC GAAACATAGA AAAAACGTGG ACAAAAAAGA CAAAAAAATG GGGTGTAGGC AGTGTAAAAA TGTAAAGATT TTCCTCGGTA TCAGTGGGGT AGGCAGTGTA GAAATGTAAT GATTCTACTC GGTATCAGCT GGGGATAGGC AGTGTAAAAA TGTAATGGTT TTACTTGTTT TCAGGGGGGT AGGTAGTGTA AAAATGTAAT GGTTTTACTT GTTTTCAGGG GGTAGGTAGT GTAAAAATGT AATGATTTTA CTCTGTATCA GGGGGTAGGT AGTGTAAAAA TGTAATGGTT TTACTTGTTT TCAGGGGGTA GGTAGTGTAA AAATGTAATG ATTTTACTCG GTACCAGGGG GGTAGGTAGT GAAGAAATGT GTATTAGGTT GTACCGTCAT TGGCTTTGTT ACGACATAAA AAAGTTTAGA GCGGCTTTCT AGTCAAAAAA GTTTCATTAT TTTACTGTGT TTTTCAATCC AAGTTTCATA ATCCTTTTTA TAAGGTATAG TAGGATGGGG GAAGATGGGA CACCTTTTCA TTCTATTTAC TCGTCCCATT TGGTAGTAAA CAAAGAACAT TCAAAGAATT ATTAAACCGT ATCCTCACGA CTTCCATGGA TTGTTGTTAA TTGTTAAAAA CACGATCAGA ATATTTAAAT ATTGCGTGAT AAAGGTGTCC TATCTTCCCC ATCCTACTAT ATATATAGAG TTCAGCTAAA TACAGATCTT TATTTGATAC AACATGGCAC GTAACGTATG GGAGCTATTA CCAGCCTAAG GCGAGTAGCC GTGAGCAAAC GCGTATATGA ATATAGTGCA GCATATTGGC AGAGATGCAT TTATGACAAA ACCGTTATAT ATGAAAGAAT AATTGATTTT TCAAGGCGTA CTTTTAAAGG TTCAATATAT TTTGAGTGTG TTTAATATTT ATTGTTATCC CTACAAGTCA TCCAGCAAAA TGACAGTAGA ATTTACTCAA ATGGAAACAA ATTATGATCA AGAGGACTAA AAAATTTGTA TTTTCCCATA TAGACTTAAC GGTATGGATT GCCGTCGCAA AAAAACACAA AAAAGACGGT AATCAAAGAC AGCTACGCGA AATAAGTTTT AATTTAAAGC AACGAAATTA ATATGTATAG GCTTATTCTG GGTTAAAATA CTCAAAATCG TGTTTGGTTT CACTGCGAGT TTACATAAGC AGTACAAAAT GATGTTTATA AAATGACCGT GTATAACTTG TATAACTTTT TAATGTAATG ATATTCTAAA TTTGCTCACA TATTTCGCTT TACAAAAATA TTCAATTTAA AATGTAAAAA CAACAAAAAC ATAATACTAA TTTGGCTTTA TTGCAAAATC TTTCGCAAGC TGCAAACGGG GACGAATAAT TTACGAAACA GACCGTTGAT CAACCGAGCA TGTCGGGAAA CCAAGTTTAT TGTGTTTCTG TATTTTGTTT GAGTTCGTAG TTGTCCCAGT TCCTGAATAC TGATAGCAGC TGTTAGCTGG TCCAGTTTAT GAAGAGTGTC AGGGTCGTAT CAGATCGGTC ATTACACTGT TGTGTGGCAA CTAAAGAATA ATGTAGTGAT TTGTAAGGGT TGTTATATCT GCTGTGGCAA ATTTTATTTA GTATTATTGT ACAAAACGGC GGTATGAGTA CTTTGCTTAT TGGCGCAACA TCACATCAGA GTTTACTTTA AATTCAAAGT ATTTGTTGGA AAAAATTGCT CGAATTATTG TTATAAAGTT AACAAACTAG ACAGCTTACA TTATTCTATA TAAAAAGCGT AAATAAATAT TTTTATAGGA TTTATTCCAG CACCCAAAAA ATCTTAACCA GTATTTTATT TTTAAATTGG TGGTTACTTT ACCACACCCC TATGAGTATG ATTAGGAGGT TGTACCCTTA TCTAACCCTT ACAGCTGTAA AGTATCAGCC ATTTTGGTGG TCCTAAACCA CTGTTACAAC CTGCCATTCA TCCCCTTTGG GTGAAAGCCA TAGCATTACA AACTGCCAAT TTAAATTGGG ATAAATTCTG TTACGTCTCT GGGGTACCTG CATTGAGTTT TTACCATACC TTAACCTGTA CAGTTAATTC CCATTTTCTT AAACATATGC GGTTTTATCT ACAGATATTG CAGATTAAGA AAAAAGTGTG AAACACATTA AGAATATAAA ACGAAAATGC ACTTTTAAAT TACGTGAAGT TTTTAAAGCC TCTCATTATG AACGGCAGCG ACACATCCAT GGCAACTCGC ATGTATGTGT GCGAGTCTGT TGAACACCCA TCATCACTGC TGTCAGGACT TAATGAACAA AGACTAAAGG TATCAATTA