Copyright © 2005-2008, Human Genome Center,
Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo. All rights reserved.
Version 2.0
D B T G R
DataBase of Tunicate Gene Regulation
Search
Query
eg: snail, muscle, ci0100133445, ...
names
tissues
transcription factors
gene ids
Browse a genome
Genome region
eg: chr09q:3065382-3068581, ...
C. intestinalis
1.0
C. intestinalis
2.0
C. savignyi
1.0
C. savignyi
2.0
Show all gene expression reporters
Show all publications
About DBTGR
Ci-GnRHR4
Gene:
Ci-GnRHR4
Ghost cluster: not found
Reference:
Kusakabe, T. (Unpublished).
This construct is available from Prof. Kusakabe.
Detected expression
Expression was detected in
epidermal neurons
.
Construct description
5'-end primer with a SalI restriction site:
GACT
GTCGAC
ATGTGGCGATGAAGAAATAG
3'-end primer with a BamHI restriction site:
AC
GGATCC
GAAACTAAAACGAAACCACA
Vector: pBluescript-EGFP
Insert size: 4981 bps
Insert sequence:
ATGTGGCGAT GAAGAAATAG TTGTAAATTA TTTTATGTTG AAATGTTTAG TTTTGGAGGA AAGCTGGTTT AATATATATT TGTTGGGAAA CTTAATAACT TTTTTTTTTA TTTCTTCCAA TACAACATTA AAGATCAACT TATTTAAAAA CGAAGACAGG GGGGGGGGGC AGCAAAACGT CAGTATTGTT AAAAACACGC TATGAATAAA AGGTGTGGGA GAGAGCGTCA GTAAAAACCG TTACTGTTTA ACTTATTTTT AGTTCTAATT ATTTCTAAAA CAACACGACA TTTCGGTTAC TGCAAAAACA TTTTTAAAAA ATACTAAAAC CCGTTTTACC CGATCCACTA GTCGCACCAT CGTTGACGTA ACTCGAGCGA GTAATTTTGT TTGGCAATTA ACTTCGTTAT TGAGTTACAC ATTGGCAGCC TATCAGTTCT TGTAGTGTAT AAATTATGAA ACATATGGGC GGTAACTTTG AACGGCGTTC GTTCCATCAA ATAGCGATCC CTTCCTACTT TAATTAAAAC TTTTTGCCAA TCTTGAAAAT TCCTACAACA AAGATATTCA CGTCACGCTA AAACATATTT TCCAAAAGCA TTTTTTTTAT TTTAAAATTA TAAAAAAGCA ACGTAATATT TATTGAGTCG AATGTTTTGC CTGCTATATG CAGCGGGACA GGTTAGCTAG GAATGAATGA AATTTATTTC GTCTCTTCCG TCACAATAAC GAATAACAAG ACAATTTATA AAAGCGAAAA AATAGGCAGT AACGGTAAAA CAACAGTTGT TGTAAAACGC TTTTTGATAA AAAAGAAAGA AATAATGTTT TGGATAAAAA GCGTGAAACC AAAGCTAGGA TCAATATGTT TATAACTTAA TGATATTCCC CCGCTTGTTA GCAGGTGGGG CTTTGGTTTC GATGAAGTCT AGTTAATGTA ACCAGCAGAT TGTTTCTTGG AAACAAAATT ATTCAAACGT AGTTTTTGAA ACAAGCATAA TATATTTTAA AAAACTGAAT CTCTGGTAGG AGAAGTTACC TTTGGATTTT GTATTTAACG TTTCTTATGG AGTGTTCGAC TTTGTTTTAT TTTTAGTAAC TTGCCTAATA TTAATAGTTG TTATATCAGA AGAACAGTTT ATGGAGGATG CATTATACCT GGTAGCAACA GCAGTAAAAC CATACAGCAT AGGTTGGGGT AGACTGACCA CCTTAAACTC TGCTTTCTAA TCCCATTTAG TAAACACAAA ATACTCAAGG AATTATAAAC TATATTTTTA CGACTCCCAA AGACCGTTGT TAACTGTTTA AACCACGATT AGGATATTTG GATATTATGT GCTAAAGGTG TCCCATCTTC CACTACCCTA TAGTCCCACA ATAAAGGCTT GTTACGATAA AATAAATATT GAACAGTATA CTGGTATGTA TAACAAACCG TATACCAGCA CAGAATAACG TGTTAATTTT AAACCAATAC GAAATCATTT TTTTGTTTCT CGATTTTTTT AATACCCCCT CCCCGCAAGG TTAACTTACG TTAAAAATAG ATGGCCGCCC CTCGTGGAAT GCGGGGACAA TGACAAATAA AGGACGCTTA ACATTTGTCT TTGCGGTTTG TGGTTGCCTA AGTAGATTAG GAAGACATGA AAACGTCAAA GCTGACACGG CGTCTCTGCA GGCCACGATT TGTAGCCTCG TGTCCAACCC GCTGGGTCGT CACCACCGCA TTAAATATTA AACACGGCCG AACAAACTCT TACCACGAGG CGTGCTGTTG CCTTGAATTA TTCAAACCCG AATAGTTTTT TTTATGAAAC ATTCACCGAT AATGACGGAT TATCCAGAAT TTCGTCCAAA AATATCGGAA AACAAAAACT TTGTTTTCTA CGCGCGTTGC TGATGTTTGA TGGGTTTTGG AATCATCGAA TAAACGTCTC ATAAACTACA TTTCAACAAA CATAATATTA AATATTTTAG CGTTGGCAGC GTTTTTTCTA TGACGTAACA ATTCTTTATT TCTACACCGA TTGTTTATCA ATTTAATTTC ACCTTTGTTC GAACGCGTTC TTTGTTACGT CACAACGACC ATCGTTAATT TGTAACAATC AGATTAGTAT CAGGAGATTT TCTTCCAACC CTGCCAGGAA AACACGGGAA TCTAATTTCG ATCAAGTGTT TCTGGTTTAT TACATGGGGA ACAAGCGAGT CTTTAACCGT ACCCCCTACA GCGCACATAA CAACCTTTTT CATGTCACCT CAAGCGTAAG TTATTGTTGT TGTTGTTCGA CCACAACGAC ATTCTAATAC CCAGCCACGC CTATTTTATC TTTGCTTCTT CCCATTATCC GTAATGTGGT ATAAAGGCTG TCATTTTGCT GCTAATTTCT CTTTCTTAGT TGTAATTTGA TTTTCGATTG TATATTCTAC CTTTCACATG CAAACCTTGG GACTTATATA CGTATTCTGA GTTGACCCCG CACCGTATTA TTATAATATA TATACGTTAC TTTAATCTAC AGCAAGCAGG GTGTAATTGT ATCCCAGTGG CTTAACCACA CAACCCTAAG TTGTGATGTA CCGTCCGACG TGTAACACCA ATATGTTAAA ACCCACTATG CTTAAAGTGA AGGGGGGTGG AGGTAAAACT ACCAATTTAA AATAACAACT TTCATTCTGC AGGGATTATC TAAGTTACCC GATTAAAGTC TTTTTGTTGC TGGCAGCTTC TACAGTTTTA TAAATATAGA AGCGTTTAAT TAGAATTGAA ATTAAACTAA TCTTATACAC GAAATAGTAA TTATTTGCAA AAGAGCATTC GTGACAGCAC ATCATTGAAT AAAACATCTA TCAGTTAAAC GGCGCGATTT TTTAAACCGA ACATAGAAAA TTCACATTAT AGTTTAATGT CACTTAACCT ATGATGTGTC AAGCATATTT GTAAATTGTG CAACTGTTTT CTTTTTAAAA CTGCAGAAAA AGAGAAATCA GACAACGAGT TTAATTATTC ATCAATCTGA TTATTTCATT TCACGATTTT CAATTCATTT GATTTAAAAT AAATTCACTT TCTGACCCCA AAATTACTTT TGTTTGGATG AATATTTAAA ATCGTACGCA TTGCAACGTC ATGTGTTGTT ATTCACACGT CAGAAAGTAA AAAATTGTGA TTGAAGAGAA GGGATTATTA CGTCATGTAT AACGCACGTG TTTTATATTC GCGGTTAGTT TTTTTATCCT GGCAAAACAA AATAAGTATT TATCGATTAT AACAAGAAAA AATGCCAAGA ATTCCATTTT GGTCGTGAAT TAAATACCCT GGGTTCAATG CAAGGTAATT TATTAAAGTA AATAAGGGCT TGGTGTCTTA TTTTATCTCT CTAGCTCCAA ATACCGCAAG TGTGTTTGTT CGTCAAACAC ATAAATTATT TCTTTGTATT GTGACGTGTC AATAGAAGAG AATAAACACC TTTGTAGCAA TTTGCAAAAA ATATGATTTT TAGGTTTAAA ATTATAAGCG CTTTTTAACA ACTGTCATTC TGTCGCTTTT CCCCTTTGCT CATTAAGTTC CGTTTCATAC ACCCCGTGCC AGCTTACAGA TTACCACGTT TTTAATTTGT GGGGATTGTT TTTTCTGTAT GCCTGACAAT CAGACGACCC ATCAGTGACC ATCACTGGTT TAAAGAAAAT TATTTCGCCA CAAATTCCGC TTTAATATCT ATTGAAAATT AAGACGAAAT TAAACGGGGT GATATGGCTT GTACTTCAAC CTGGGATCAG CGGTTGTCTT TATCTCTTAA TAAAATAATA AATCATCGTT TTTGGAAATC GAATGTTTAT CGTTGCGGAG AAAGGCGTCG ATTGTGTTTG AGAAACAGCA GTTCTAGATC AAACGTAACA AAGGACAATT GTTTGGCTAC AGTAAATATT GGAATGTCGT TTGGGAAGAA ACGACGATGA AATTTCCGGG GTGTTCGTTT GGTTGTTTTG GAGTCTAACC TGGCTTTGGT TGGACTTCAG CAATACCAAG TATTGTAACA TAGCATGTGA GTTTACTGTG AAGTATTTTC GTTGTTTTAC TAATATGATG TTGTCGTGGT CCAAAAGTGT GGAACAAAAA CCAAATTTTT TTCAGTTGAC GAAACCTGTT TGTTACCGTT TTAAATATTG TATGCGTAAA TTAACAAGTT ATAACTATAG TAGGGCGGGG TGAGATAGCC TATGTTTCCC ACAGTAAAAC TATATATATG TTACGAATGC ATGTGCGATT TATCATTGTC TTGATAAAGG TTAGCCTATA TAGTATTGTT ATTGTGACGT CATAGAGGAT CGGTGTTTGC GCCTTTTTCA GCGAGGAAGC TTCCTTTTGC TTGGTTGCCT CATTCGTCTA ATTTCGCTCG AACGCAATCG TGGGTCGCAA CGATAAGAGG TGTGTAGGTT AATGTAGCCA CGGTGTTTGG AGAGGGGGTG TAATTGATAT ATTTTGCTGC TTTCAAAAGG CTAAGTTTGG AAAATATCAA GTTTAAAATT CATTGCCAAT TTGTAATGGT TGGTAAACTA CTGGATTAAG CGTTGTCCTT ATGAGAGGCA GAGACACTTT TAATGGAATA TAAAGAAAAA GTGGCGTCGT TATGCAACGT TTTGTTCAAC AGCAATATTA CCATACTGGG CAATGCAAGG TTAAGGAAGT TGTTGTAAGA TTGTTTGAGC AGATACGAAA TATATCTTGC GTTTCATCTT CAAGGTAGAA GGAAAGATTT CAGCGAAAAG TTTTTGGCTT TATTTGACTT TTTCTCAAGT AGTCTTTACT TGTACCTTTA TCTAACAACA GTGTTTTGCT GCTAGTTTCC TTCTATTCGT TGTTTTAATT AATTTGTTTG TATTGGATGA GGTAGATAAG CTTATGTTAT ATTACTTTTA ACTGTTTATG ATATTTGATT TAGGTCTCAC AATTCTAGGT TTGTGGTTTC GTTTTAGTTT C